子宫内膜异位症发病的原因，可能与下列因素有关：

①子宫内膜种植。

②体腔上皮化生。

③淋巴或静脉播散。子宫内膜之所以异位，主要是经血倒流，例如经血未净时性交，妇科检查、输卵管通畅检查(输卵管通液或输卵管造影)等，使子宫内膜碎片混在经血中倒流入输卵管及盆腔;子宫后屈、宫颈狭窄、阴道和处女膜闭锁等，致使月经流出不畅，也可使经血逆流，进入盆腔后种植在卵巢表面或盆腔腹膜表面，成为子宫内膜异位症。

④免疫功能异常：免疫学的功能是将异常细胞和细菌从体内清除。逆流的经血可能超过了身体清除内膜细胞的能力，这就可能导致残存内膜组织的种植和生长。

⑤遗传因素：其姊妹或母亲患内膜异位的妇女则发生此病的机会明显增加。