目前对于子宫内膜异位症的发病原因没有明确的结论，不过经长期观察研究表明，引起子宫内膜异位症的原因主要有以下几个方面：

自身因素：由于部分患者自身盆腔、宫腔以及腹腔内压力不平衡，从而导致子宫内膜被吸入腹腔以及盆腔等地，引发子宫内膜异位症。此外还有部分患者由于自身内分泌失调，自身雌激素偏高或孕激素缺乏，从而刺激子宫内膜的异位生长，引发子宫内膜异位症。

人为因素：女性多次的人工流产、剖宫产以及刮宫术等可能造成子宫壁损伤，使得宫腔内血液中含有子宫内膜并进入到盆腔各处异位生长，从而引发子宫内膜异位症。

先天因素：长期观察发现，一部分子宫内膜异位症患者存在家族遗传病史，因此认为引起子宫内膜异位症的原因可能与遗传因素有关。