试管婴儿往往没有自然受精的婴儿聪明，患心理疾病尤其是自闭症的可能性也较大。
由于正常受精过程，是在女方体内进行，精子和卵子在输卵管内结合，最后游走到子宫。整个过程温度为女方体温。但试管婴儿是需要将胚胎冷冻然后再解冻，还需要使用一些试管婴儿实验的药物才能完成。在这个过程中就可能导致婴儿先天性缺陷。
影响试管婴儿健康和成功的因素
1、年龄
是影响IVF成功率的重要因素，随年龄增长，卵子数量减少，质量下降，受精率下降，妊娠率明显降低，流产率增加。41岁到42岁妇女的妊娠率为12%，42岁以上的妇女每移植胚胎的活产率仅为5.9%，43岁以上妇女的流产率达50%。
2、输卵管积水
显著降低胚胎着床率和妊娠率，使妊娠率下降50%。因此，有输卵管积水的妇女在进行IVF前应切除积水之输卵管。
3、宫异常
如子宫内膜息肉、子宫内膜炎、既往手术或炎症（结核最常见）导致子宫内膜损伤，都可以影响胚胎着床。
试管婴儿是亲生的吗
试管婴儿是体外受精，那么需要从男女双方的体内取出精卵，只要精卵来自夫妻双方，孩子就是亲生的！
但是因为各种各样的原因，可能男方精子用不了或者女方卵子用不了，那么这个时候如果想要孩子的话，就需要借用别人的了。
一、如果是借用卵子，那么孩子和母亲就没有血缘关系，但是和父亲依然是亲爹和亲儿子的关系
二、如果是借用精子，那么孩子和母亲是亲生妈妈和亲生儿子的关系，和爸爸是没有血缘关系的
三、如果精卵都需要借的话，那这个孩子和领养的差不多了，和父母双方都没有血缘关系
以上三条也适用于借用第三方辅助代怀孕，目前来看大部分家庭都是使用自己的精卵通过试管婴儿达到怀孕的目的，少部分家庭因为年龄，以及卵巢早衰等问题，需要借用别人的卵，这种情况相对于整个不孕不育群体来说占比并不大，所以正确的说法应该是试管婴儿90%的都是亲生的。
